• Re: 有人做quantitative western blot吗?

    你只要所用的抗体稀释度不会造成你的信号out of linear range就可以

    你每一块胶都跑一个同样的标准样品,并用它来normalize你的同一块胶的其他样品,

    这样胶与胶之间的数据就具有可比性了

    据我的经验,降低抗体用量一般会增加线性范围,相反如果你增大抗体用了,

    就有可能缩小线性范围,换句话说,只要你始终是用同一稀释度,抗体效价虽然有所损失,但并不会造成你原来在linear范围之内的数据变成out of linear range,但是抗体过少,检测到的信号会偏弱,噪音就会增加,所以选择一个合适的稀释度是很重要的,我们一般在保证信号不out of linear range的情况下,选择用尽可能多的抗体和上样量。�

    此外,选择好的仪器和试剂盒也会很大程度上改善线性范围给试验带来方便,如前面fungal提到的Odyssey系统就是目前来说比较好的流行的作定量WB,不但线性范围要宽,而且可以双色标记同时作两个不同的蛋白。

    【 在 chenxiaoyin (Zeratul) 的大作中提到: 】

    : 我因为有一个抗体是非commercial的,所以我每次作western都用同一管稀释后的抗体,所以是不是会由于抗体的损失,每次和每次之间都不具有可比性?

    2007-11-17
  • QoQ来报到啦

    ID?:

    QoQ

    目前的机身?:

    K10D and ZX-5N

    目前的镜头配置?:

    DA16-45/4,FA*24/2,FA31/1.8,M40/2.8, FA43/1.9,FA50/1.4, FA77/1.8, FA*85/1.4,DA50-200/4-5.6,CZJ 135/3.5, Takumar SMC 50/4 Macro

    附件?比如脚架,闪光灯,包,等等:

    AF360,一堆UV

    从什么时候开始中毒?:

    半年多前

    喜爱的拍摄题材范围?:

    人像为主

    下一步的配置计划?:

    暂无

    想对大家说的?:

    新年好!新手,请多多指教

    2007-02-22
  • Re: 哀悼!

    曾几时还一起老乡集会,一起坐火车回家,在一起有说有笑,怎么也不敢相信会有抑郁症

    更没想到会有这种事发生,哀悼阿!

    【 在 toluckar (毕业,新生活) 的大作中提到: 】

    : 刚刚在家里吃过晚饭,同学就打电话过来告诉我这个震惊的消息。

    : 连忙又来到系里,上网核实。

    : 麻木的一一看过网上的消息,不知自己在想些什么

    : ...................

    2006-11-03
  • Cancer Res,付实验室

    1: Cancer Res. 2006 Aug 15;66(16):8049-57.  Links

    Wilms' tumor 1 and signal transducers and activators of transcription 3 synergistically promote cell proliferation: a possible mechanism in sporadic wilms' tumor.Rong Y, Cheng L, Ning H, Zou J, Zhang Y, Xu F, Liu L, Chang Z, Fu XY.

    Department of Biological Sciences and Biotechnology and Institute of Biomedicine, Tsinghua University.

    Transcription factor Wilms' tumor 1 (WT1) was originally identified as a tumor suppressor for Wilms' tumor, but it is also overexpressed in a variety of cancer cells, suggesting a potential oncogenic function of WT1. It is important to understand molecular mechanisms underlying these dual functions of WT1 in tumorigenesis. In the current study, we report a synergistic role for signal transducers and activators of transcription 3 (STAT3) and WT1 in tumor development, including Wilms' tumor. STAT3 interacts with WT1 through its conserved domains both in vitro and in vivo. When STAT3 is activated, expression of WT1 enhances STAT3 transcriptional activity. Overexpression of WT1 and STAT3CA in NIH 3T3 increases the expression level of STAT3 target genes, including cyclin D1 and Bcl-xL, which results in an advantage of cell proliferation. Our results suggest that in the presence of activated STAT3, WT1 promotes cell proliferation instead of suppressing cell proliferation. Strikingly, STAT3 translocates to the nucleus and interacts with WT1 in a variety of primary Wilms' tumor cells, raising the hypothesis that WT1 and activated STAT3 in Wilms' tumor accelerate tumorigenesis. (Cancer Res 2006; 66(16): 8049-57).

    2006-08-19
  • 两篇J Virol,Rao实验室

    New Antiviral Target Revealed by the Hexameric Structure of Mouse Hepatitis Virus Nonstructural Protein nsp15.Xu X, Zhai Y, Sun F, Lou Z, Su D, Xu Y, Zhang R, Joachimiak A, Zhang XC, Bartlam M, Rao Z.

    Laboratory of Structural Biology, Life Sciences Building, Tsinghua University, Beijing 100084, China. raozh@xtal.tsinghua.edu.cn.

    The unique coronavirus transcription/replication machinery comprised of multiple virus-encoded nonstructural proteins (nsp) plays a vital role during initial and intermediate phases of the viral life cycle. The crystal structure of mouse hepatitis virus strain A59 (MHV-A59) nsp15 is reported at 2.15-A resolution. nsp15 is an XendoU endoribonuclease and is the first one from this family to have its structure unveiled. The MHV-A59 nsp15 monomer structure has a novel protein fold. Two nsp15 trimers form a back-to-back hexamer that is believed to be the functional unit. The structure reveals the catalytic site including the highly conserved residues His262, His277, and Lys317, which is supported by mutagenesis analysis. Gel filtration and enzyme activity assays confirmed that the hexamer is the active form for nsp15 and demonstrate the specificity of nsp15 for uridylate. The high sequence conservation of nsp15 in coronaviruses, including that of severe acute respiratory syndrome, suggests that this protein may provide a new target for the design of antiviral therapeutics.

    Display  Summary Brief Abstract AbstractPlus Citation MEDLINE XML UI List LinkOut ASN.1 Related Articles Cited Articles Cited in Books CancerChrom Links Domain Links 3D Domain Links GEO DataSet Links Gene Links Gene (GeneRIF) Links Genome Links Project Links GENSAT Links GEO Profile Links HomoloGene Links Nucleotide Links OMIA Links OMIM (calculated) Links OMIM (cited) Links BioAssay Links Compound Links Compound via MeSH Substance Links Substance via MeSH PMC Links Cited in PMC PopSet Links Probe Links Protein Links SNP Links Structure Links UniGene Links UniSTS Links Show  5 10 20 50 100 200 500 Sort by Pub Date First Author Last Author Journal Send to Text File Printer Clipboard E-mail Order

    All: 1    Review: 0

    1: J Virol. 2006 Aug;80(16):7902-8. Links

    Dodecamer Structure of Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus Nonstructural Protein nsp10.Su D, Lou Z, Sun F, Zhai Y, Yang H, Zhang R, Joachimiak A, Zhang XC, Bartlam M, Rao Z.

    Laboratory of Structural Biology, Life Sciences Building, Tsinghua University, Beijing 100084, China. raozh@xtal.tsinghua.edu.cn.

    The severe acute respiratory syndrome coronavirus (SARS-CoV) nonstructural proteins nsp1 to nsp16 have been implicated by genetic analysis in the assembly of a functional replication/transcription complex. We report the crystal structure of nsp10 from SARS-CoV at 2.1-A resolution. The nsp10 structure has a novel fold, and 12 identical subunits assemble to form a unique spherical dodecameric architecture. Two zinc fingers have been identified from the nsp10 monomer structure with the sequence motifs C-(X)(2)-C-(X)(5)-H-(X)(6)-C and C-(X)(2)-C-(X)(7)-C-(X)-C. The nsp10 crystal structure is the first of a new class of zinc finger protein three-dimensional structures to be revealed experimentally. The zinc finger sequence motifs are conserved among all three coronavirus antigenic groups, implicating an essential function for nsp10 in all coronaviruses. Based on the structure, we propose that nsp10 is a transcription factor for coronavirus replication/transcription.

    2006-07-31
  • Re: 网友K1utz报到

    你搞错啦,这个ID不是我,我想注册,可惜水母两个K1utz都被抢啦

    不过我也属于CDP的,还真是巧了

    【 在 McKinsey (得失之间) 的大作中提到: 】

    : QoQ,又是你,不要以为你换个马甲我就不认识了。。。。

    : 看了这一期科学美国人的那一捆synthetic biology先锋们写的文章没?

    2006-06-21
  • Fundamentals of Cancer Research Short Course Webcast

    Maybe some guys interest this course webcast.

    http://web.mit.edu/ccr/news/#shortcourse

    2006-06-07
  • Re: BME学科的发展Re: 关于MIT的Biological Engineering Divisi

    嗬嗬,其实这个现象很普遍,那个系都有一些这样的教授吧

    【 在 pygm (Under Quarentine) 的大作中提到: 】

    : 对阿,其实还是满有意思的

    : 毕竟是做出“有用”的东西来。

    : 但是普渡这bme faculty真的是凑出来的

    : ...................

    2006-04-01
  • Re: 下个月的Nature Review MCB

    Thanks!

    A helpful paper for me !

    【 在 McKinsey (得失之间) 的大作中提到: 】

    : 下一期好像是system biology的专辑,现在下面这篇文章可以下载了。

    http://www.nature.com/nrm/journal/vaop/ncurrent/full/nrm1838.html

    : Review

    : ...................

    2006-02-19
  • CMLS-Meng Lab

    : Cell Mol Life Sci. 2006 Feb 7; [Epub ahead of print] Related Articles, Links

    Nodal signals pattern vertebrate embryos.

    Tian T, Meng AM.

    Laboratory of Developmental Biology, State Key Laboratory of Biomembrane and Membrane Biotechnology, Department of Biological Sciences and Biotechnology, Tsinghua University, Beijing, 100084, China, mengam@mail.tsinghua.edu.cn.

    Vertebrate embryonic patterning requires several conserved inductive signals-including Nodal, Bmp, Wnt and Fgf signals. Nodal, which is a member of the transforming growth factor beta (TGFbeta) superfamily, activates a signal transduction pathway that is similar to that of other TGFbeta members. Nodal genes, which have been identified in numerous vertebrate species, are expressed in specific cell types and tissues during embryonic development. Nodal signal transduction has been shown to play a pivotal role in inducing and patterning mesoderm and endoderm, and in regulating neurogenesis and leftright axis asymmetry. Antagonists, which act at different steps in the Nodal signal transduction pathway, have been shown to tightly modulate the inductive activity of Nodal.

    2006-02-11
  • JBC-Rao Lab

    J Biol Chem. 2006 Feb 7; [Epub ahead of print] Related Articles, Links

    Crystal structure of the V domain of human Nectin-like molecule-1/SynCAM3/TSLL1/IGSF4B, a neural tissue-specific immunoglobulin-like cell-cell adhesion molecule.

    Dong X, Xu F, Gong Y, Gao J, Lin P, Chen T, Pen Y, Qiang B, Yuan J, Peng X, Rao Z.

    Laboratory of Structural Biology, Tsinghua University, Beijing 100084.

    Nectins are Ca2+-independent immunoglobulin (Ig) superfamily proteins that participate in the organization of epithelial and endothelial junctions. Nectins have three Ig-like domains in the extracellular region and the first one is essential in cell-cell adhesion and also plays a central role in the interaction with the envelope glycoprotein D (gD) of several viruses. Five Nectin-like molecules (Necl-1~5) with similar domain structures to those of Nectins have been identified. Necl-1 is specifically expressed in neural tissue, has Ca2+-independent homophilic and heterophilic cell-cell adhesion activity and plays an important role in the formation of synapses, axon bundles and myelinated axons. Here we report the first crystal structure of its N-terminal Ig-like V domain at 2.4 A, providing insight into trans-cellular recognition mediated by Necl-1. The protein crystallized as a dimer, and the dimeric form was confirmed by size-exclusion chromatography and chemical cross-linking experiments, indicating this V domain is sufficient for homophilic interaction. Mutagenesis work demonstrated that Phe82 is a key residue for the adhesion activity of Necl-1. A model for homophilic adhesion of Necl-1 at synapses is proposed based on its structure and previous studies.

    2006-02-11
  • Re: 祝各位新年愉快

    re!

    【 在 lylover (白愁飞) 的大作中提到: 】

    : 在新的一年里,愿大家多多灌水。

    2006-01-28
  • sigh,今天发现一个牛人

    一个实验室几年内连着发了数篇JBC,结果用同样的细胞系,同样的实验方法

    得到的结论正好相反,一会儿说凋亡是FADD依赖的,一会儿说与FADD无关而且Introducation说自己已经做出来有关,然后dicussion就一字不提啦

    一会儿说用反义模板搞掉FLIP,说还不能诱导凋亡,下一篇文章又可以拉

    一会儿说抑制NF-kappB对TNF诱导的凋亡没有影响,一会儿又说可以明显促进其凋亡

    他们做出来FLIP可以抑制NF-kappaB,可我发现的几篇文献全都是促进的包括用同样细胞系的。这都叫什么事啊,不得不佩服

    搞得我我也比较郁闷,不知道该相信那个结果,白读了一晚上文献

    You should believe:

    Everything would be OK if you try!

    So please pay no attention to anything,

    and then successes will stealthily visit you while time is fleeting!

    2006-01-19
  • Re: gx

    re!

    【 在 kingsyl (早晨才上这里) 的大作中提到: 】

    : haha

    2006-01-18
  • Re: 今天听了Drew Endy的talk

    really,给我们做presentation连PPT都不作就在那边讲

    【 在 McKinsey (得失之间) 的大作中提到: 】

    : 兴奋的不能自已。。。

    : 对他敬仰如滔滔江水

    2006-01-13
  • 国内那些机构或大学的干细胞研究比较好啊

    ft,我问的是国内

    【 在 Pasadena (Now you are on the Pasadena Highway....) 的大作中提到: 】

    : Harvard...

    2005-06-02
  • ZZ from USTC about Chemistry @ Harvard

    悔死了,早几天套的话可能我就去了,艾天意啊.

    USTCers,等博士后时再努力吧

    Dear XX,

    Thank you for your note.

    I do believe your background is strong. Unfortunately, you contacted me

    after the admissions committee met and made decisions. As of now only

    3 or 4 students were admitted from China and for the first year I don't

    believe any were admitted from my favorite school, USTC. In future, I

    would recommend to you and your classmates that you make your

    interest known well in advance (during start of admissions) since this is

    a time that I can offer help, and have done so to many students in the

    past.

    I am sorry that I cannot be more positive at this time, and wish you the

    Dear XX,

    Thank you for your note.

    I do believe your background is strong. Unfortunately, you contacted me

    after the admissions committee met and made decisions. As of now only

    3 or 4 students were admitted from China and for the first year I don't

    believe any were admitted from my favorite school, USTC. In future, I

    would recommend to you and your classmates that you make your

    interest known well in advance (during start of admissions) since this is

    a time that I can offer help, and have done so to many students in the

    past.

    I am sorry that I cannot be more positive at this time, and wish you the

    best of luck with your future career.

    Best regards, Charles

    2005-02-01
  • 阿朱赋(转载)

    问花花不语:为谁落?为谁开?香酙玉露,燕去楼空,纵留那听香水榭,又待谁归?云换天开,雷雨大作,横劈闪电破空。青石桥畔,一缕芳魂散了……  

      倚东风,巧笑嫣然,转盼万花羞落,乱红纷飞。至如今,透云锁雾重,琴韵小筑,玉人安在?但伤心,冷落黃昏,数声画角,金樽苦酒,独自相催,君有语托我醉梦来,渺万里层云,千山暮雪,支影残生为卿!

      

      天下女儿众芳芸芸,合《红楼》轻叹:公子多情,丫头薄命,天国晴雯,未知安好?重整《天龙》,谁可还我阿朱?如若阿碧溶尽江南温柔,阿朱则赋江南之灵秀多情!可怜红颜薄命。仰天长叹,只听风雷阵阵,几处晚鸦争巢去。每读那风雨夜,断桥边,又怎潸然泪下,心绪跌宕起伏。重回首:几多涟漪,几多凄苦,却分明寻出残绪无情。  

      卿本佳人,日日太湖渔歌唱晚,船划藕间剥菱嬉娱。软语莺莺,如斯美景,极尽春色,如非一宿风波,在此觅得佳偶却也神仙眷侣。可惜,江湖纷争,一朝卷入是非,感慨误了一代红颜!杏子林中,初见萧郎,义气神功两无双,差幸竟落贼手,遇相救!为助公子,上少林,若非萧君再救,就此魂归天国,岂非不幸!纵然主人恩重亦未必生死相报,既蒙相救,肉帛羞羞,尽偎依,芳心暗许,可怜命垂危。英雄气盖苍生,为救伊人,虽千万里吾往矣!待重生,恩情难禁,悄立雁门,苦候五昼六夜,不论胡汉恩仇,只为一腔深情。此番情,原仅天上有,世间何得闻?阿朱!阿朱!天下英雄争呼:“得妻如此,夫复何求?”

      可怜佳期如梦,旖旎风光难持久;千里随君,妾意绵绵终不敌,仇思恨志两绕缠。易容神技,欢亦她,悲亦她,一朝由得它。转瞬玉殒香销,争是造化弄人!细推知:君情重,恨意浓!但教情郎询清楚,又何至弄得:一掌击下,电闪雷鸣,苍天洒泪,魂断小镜湖畔,“塞上牛羊”也散湟惶欤。兑无尽!可恨,萧君仇令智昏,佳人幽逝,实在难脱干系!叹卿情深至愚,更是糊涂,草草定论“带头大哥”,不查其中蹊跷,代父受过,虽虚表孝心,而实护爱郎,不想却自险囹圄,误入绝路,虽死尤难补过,你叫萧峰以后怎生得活?原本也两情相牵,如今,一弦绝断,余弦安能奏出优美华章?从此,情郎孤寂红尘,全忠义终自绝收场,何等凄壮悲凉!

    直令我掩卷大哭三声!弥留之际,爱郎悟得深意,但黄泉路近,纵有一丝欣慰也只得依依不舍离去……托付小妹,本想解君寂寞,不想却害得爱郎命丧雁门。你如地下有知,可会瞑目?   

    岁也深,夜也深,遥告苍穹;阿朱,你的情义,你的遗憾,你不可饶恕的错误会在秋天的午夜随枫叶漫天飞舞,最后结成一帘幽梦飘砌塞上!

    2004-02-08
  • DNA ladder与细胞凋亡

    这与药物有关,最快的1个小时就可以看到大片段的DNA

    Ladder一般在4个小时左右吧(高效的药物如VP16,CPT)

    另外跟细胞系也有关

    而且有些药物是不诱导DNALadder的!

    【 在 chinazhy (dodo) 的大作中提到: 】

    : 请问,DNA Ladder的产生是在凋亡发生的哪个阶段?

    : 大约多少小时可以看到。

    2003-04-15
  • Re: 谁知道出国的代理,快一点的,谢谢啦

    211。140。27。146:80

    202.105.138.115 80

    【 在 kuku30 (kuku) 的大作中提到: 】

    2003-02-22